Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms