Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms