Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms