Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms