Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms