Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK3Q9UBP4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms