Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP2BPQ9P2M1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms