Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms