Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms