Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms