Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms