Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms