Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms