Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPAS1Q99742 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms