Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms