Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms