Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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