Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2Q96I99 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms