Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ULK4Q96C45 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms