Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms