Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms