Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMC1Q8TDI8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC1Q8TDI8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms