Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms