Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms