Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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