Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN12Q6ZSI9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms