Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms