Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRWD3Q6RI45 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRWD3Q6RI45 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRWD3Q6RI45 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms