Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO4Q6EEV6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms