Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms