Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms