Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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