Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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