Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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DDX39BQ13838 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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DDX39BQ13838 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDX39BQ13838 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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