Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms