Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms