Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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AP3B2Q13367 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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