Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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