Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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