Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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