Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGXB3Q12766 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGXB3Q12766 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
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