Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms