Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms