Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms