Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms