Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms