Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL10A1Q03692 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL10A1Q03692 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL10A1Q03692 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms