Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms