Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms