Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME5P56597 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME5P56597 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms